In this work, the effect of copper and zinc on green alga Pseudokirchneriella subcapitata was evaluated through catalase activity, lipid peroxidation by TBARS essay, growth rate, and the chlorophyll-a concentration. Catalase activity increased significantly (P < 0.05) in comparison to the control at 0.1 mg L-1 copper and 0.075 mg L-1 zinc, whereas the damage to the cell membrane expressed as nmols/106 cell of malondialdehyde increased significantly (P < 0.05) at 0.025 mg L-1 copper and 0.1 mg L-1 zinc. On the other hand, a significant (P < 0.05) decrease in chlorophyll-a concentration was found at 0.075 mg L-1 of both metals. The results showed that catalase activity, lipid peroxidation, and chlorophyll-a concentration were more sensitive to metals than the growth rate.En este trabajo, se evaluó el efecto del cobre y zinc en la alga verde Pseudokirchneriella subcapitata a través de la actividad catalasa, peroxidación lipídica por el ensayo TBARS, tasa de crecimiento y concentración de clorofila-a. La actividad catalasa aumentó significativamente (P < 0,05) en comparación al control en 0,1 mg L-1 y 0,075 mg L-1 de cobre y zinc respectivamente, mientras que el daño en la membrana celular expresado en nanomols/106 células de malondialdehído aumentó significativamente en 0,025 mg L-1 y 0,1 mg L-1 de cobre y zinc respectivamente. Por otra parte, hubo una disminución significativa (P < 0,05) en la concentración de clorofila-a en ambos metales a 0,075 mgL-1. Los resultados mostrados en actividad catalasa, peroxidación lipídica y concentración de clorofila-a son parámetros más sensibles que la tasa de crecimiento a los metales.