Taxonomic distinction is a measure of diversity that has a number of advantages that provides relevant connotation to theoretical and applied ecology. The usefulness of this type of measure as an alternative method for assessing the biodiversity of soft-bottom benthic marine ecosystems was tested using the indices of average taxonomic distinctness (Delta+) and variation in taxonomic distinctness (Lambda+) for mollusk communities of the Gulf of Batabanó (Cuba). For this purpose, inventories of soft bottom benthic mollusk species obtained in the period 1981-1985 and the years 2004/2007 were used. Both species lists were analyzed and compared at spatial and temporal scales. The taxonomic composition, between the period 1981-1985 and years 2004 and 2007, consisted of 3 classes, 20 orders, 60 families, 137 genera and 182 species observed. With the exception of the class level, a non-significant decrease of this composition in 2004 and 2007 was detected. At a spatial scale, a significant decrease in the taxonomic richness was observed in 2004. Significant differences were not detected in Delta+ and Lambda+ to time scale, but at spatial scale, results revealed significant differences that could be attributed to the combined effect of increased anthropogenic activities in the region with hurricane induced effects. These results suggest that the pair of indices, Delta+ and Lambda+, are good descriptors of the biodiversity of soft-bottom benthic mollusk communities in the Gulf of Batabanó.La distinción taxonómica es una medida de diversidad que presenta una serie de ventajas que dan connotación relevante a la ecología teórica y aplicada. La utilidad de este tipo de medida como otro método para evaluar la biodiversidad de los ecosistemas marinos bentónicos de fondos blandos del Golfo de Batabanó (Cuba) se comprobó mediante el uso de los índices de distinción taxonómica promedio (Delta+) y la variación en la distinción taxonómica (Lambda+) de las comunidades de moluscos. Para este propósito, se utilizaron los inventarios de especies de moluscos bentónicos de fondos blandos obtenidos en el periodo 1981-1985 y en los años 2004 y 2007. Ambos listados de especies fueron analizados y comparados a escala espacial y temporal. La composición taxonómica entre el periodo y años estudiados se conformó de 3 clases, 20 órdenes, 60 familias, 137 géneros y 182 especies, observándose, excepto en el nivel de clase, una disminución no significativa de esta composición en 2004 y 2007. A escala espacial se detectó una disminución significativa en la riqueza taxonómica en el 2004. No se detectaron diferencias significativas en Delta+ y Lambda+ a escala temporal, pero si a escala espacial, hecho que se puede atribuir al efecto combinado del incremento de las actividades antropogénicas en la región con los efectos inducidos por los huracanes. Estos resultados sugieren que el par de índices Delta+ y Lambda+ son buenos descriptores de la biodiversidad de las comunidades de moluscos bentónicos de fondos blandos del Golfo de Batabanó.