Automatic analysis of zooplankton using digitized images: state of the art and perspectives for Latin America
Análisis automático de zooplancton utilizando imágenes digitalizadas: estado del conocimiento y perspectivas en Latinoamérica
| dc.contributor | en-US | |
| dc.contributor | es-ES | |
| dc.creator | Medellín-Mora, Johanna | |
| dc.creator | Escribano, Rubén | |
| dc.date | 2017-05-01 | |
| dc.date.accessioned | 2020-11-05T13:35:47Z | |
| dc.date.available | 2020-11-05T13:35:47Z | |
| dc.identifier | http://lajar.ucv.cl/index.php/rlajar/article/view/vol41-issue1-fulltext-2 | |
| dc.identifier | 10.3856/vol41-issue1-fulltext-2 | |
| dc.identifier.uri | https://revistaschilenas.uchile.cl/handle/2250/158778 | |
| dc.description | The study of zooplankton communities is very important in the context of the biology, ecology, and conservation of the marine ecosystem. However, research on zooplankton implies a highly costly process in terms of time and effort, requiring trained personnel for identification, counting and measuring of various taxonomic groups, including biomass estimates. At present, there is an increasing interest for implementing new techniques allowing automatic analyses of zooplankton by means of informatics technology and assessment of digitized images. In this work, the state of the art of some methodologies applied to digital images of zooplankton is revised describing the general methods used, such as ZooScan-ZooProcess and ZooImage, and an analysis of their results for identification, a comparison with traditional methods, and recommendations to improve the identification process. Additionally, a brief summary of the experiences with these systems is presented, focused on the analysis of spatial and temporal variability of the zooplankton community by means of its size spectrum and tests for deriving biomass estimates. Finally, a list of capacities and limitations of the methods is discussed using recent literature, as well as the perspectives of development and applications of this new technology can offer to the scientific community of the Latin American region. | en-US |
| dc.description | Los estudios de comunidades de zooplancton son de gran importancia para la biología, ecología y conservación del ecosistema marino. Sin embargo, estas investigaciones implican un proceso de alto costo en términos de tiempo y esfuerzo, requiriendo personal entrenado para la identificación, conteo y medición de numerosos grupos taxonómicos, así como para la estimación de biomasa. Actualmente, existe un creciente interés por la implementación de nuevas técnicas que permitan automatizar los análisis, incorporando tecnología informática aplicada al examen automático de imágenes digitalizadas. En este trabajo se revisa el estado del conocimiento de algunas metodologías, basadas en el estudio de imágenes digitalizadas de zooplancton. Se presenta una descripción general de los métodos conocidos, tales como ZooScan-ZooProcess y ZooImage, se analizan sus resultados para la identificación de distintos zooplancteres, se comparan con el método tradicional y se hacen propuestas para mejorar su aplicación. Adicionalmente, se resumen las experiencias con estos sistemas en el análisis de patrones de variabilidad espacial y temporal de la comunidad zooplanctónica, basados en el espectro de tamaño y pruebas para la estimación de biomasa de zooplancton. Finalmente, se elabora un listado de capacidades y limitaciones registradas en la bibliografía reciente, y se discute sobre las perspectivas de desarrollo y aplicación que ofrece esta metodología para la comunidad científica en Latinoamérica. | es-ES |
| dc.format | application/pdf | |
| dc.language | spa | |
| dc.publisher | Pontificia Universidad Católica de Valparaíso | en-US |
| dc.relation | http://lajar.ucv.cl/index.php/rlajar/article/view/vol41-issue1-fulltext-2/662 | |
| dc.source | Latin American Journal of Aquatic Research; Vol 41, No 1 (2013); 29-41 | en-US |
| dc.source | Plataforma para envío de artículos - Latin American Journal of Aquatic Research; Vol 41, No 1 (2013); 29-41 | es-ES |
| dc.source | 0718-560X | |
| dc.source | 0718-560X | |
| dc.subject | zooplankton; automatic identification; digital analysis; state of the art; ZooImage; ZooScan | en-US |
| dc.subject | zooplancton; identificación automática; análisis digital; estado del conocimiento; ZooImage; ZooScan | es-ES |
| dc.title | Automatic analysis of zooplankton using digitized images: state of the art and perspectives for Latin America | en-US |
| dc.title | Análisis automático de zooplancton utilizando imágenes digitalizadas: estado del conocimiento y perspectivas en Latinoamérica | es-ES |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/article | |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion | |
| dc.type | en-US | |
| dc.type | es-ES |