The Piratininga-Itaipu Lagoon System and its drainage basin, located on the southeastern coast of Brazil, Niterói (RJ), has been the target of an intense process of urbanization over the last four decades. As a result of this process, both the lagoon and the adjacent sea area have shown signs of eutrophication due to the release of large quantities of domestic sewage semi (or not) treated. In an attempt to minimize these effects, in 2008 the government re-established a connection between the Piratininga lagoon and the sea. To evaluate changes and variations in the balance of dissolved inorganic nutrients, before and after interventions, the geochemical model of two stoichiometric mass balance boxes of the "LOICZ Program” (Land-Ocean Interactions in the Coastal Zone) was used. The salt and water balance showed different water residence times in the Piratininga lagoon for the two periods: 2005-2006 (before the opening of the connection between the Piratininga lagoon and the sea) and 2009-2010 (after the opening of the connection with the sea). The first period showed a value about two times higher than that obtained for 2009-2010, τ = 83 and 39 days respectively. The water residence time of the Itaipu lagoon did not show great variations between the two periods (τ = 9 and 8 days). For the period of 2005-2006, before the opening of the connection with the sea, both the lagoons were autotrophic (∆DIP > 0) and nitrogen loss was predominant (∆DIN < 0). The second period (2009-2010) was characterized by changes only in the trophic state of the Piratininga lagoon, which became heterotrophic (∆DIP > 0).El Sistema Lagunar y su cuenca de drenaje, localizada en la costa sudeste de Brasil, Niterói (RJ), han sido objeto de un intenso proceso de urbanización en las últimas cuatro décadas. Como resultado, tanto el área lagunar como el área costera adyacente han mostrado signos de eutrofización debido a la liberación de aguas residuales domésticas tratadas y no tratadas. En un intento por minimizar estos efectos, el gobierno restableció en el 2008 la conección, que une la laguna de Piratininga con el mar. Para evaluar los cambios y lasvariaciones de los balances de nutrientes inorgánicos disueltos, antes y después de las intervenciones, se utilizó el modelo geoquímico LOICZ. El balance de agua y sal mostró tiempos de residencia de agua diferenciados para los dos períodos simulados. Para el periodo 2005-2006 en Piratininga, mostró un valor casi dos veces superior al obtenido después de la apertura de la conexión con el mar, τ = 83 y 39 días respectivamente, la laguna de Itaipu no reveló gran variación entre los dos períodos (τ = 9 y 8 días). Para el periodo 2005-2006, antes de la apertura de la conección con el mar, ambas lagunas fueron autotróficas (ΔDIP> 0) y con procesos de pérdida de nitrógeno (ΔDIN < 0). El segundo periodo (2009-2010) fue caracterizado por cambios en el estado trófico solo en la laguna de Piratininga que pasó a estado heterotrófico (ΔDIP > 0).