This work presents a distribution of medicinal plants and active substances from Cajamarca Department (Peru) under a bioclimatic criterion. The results show that 108 medicinal plants are spread among five bioclimatic belts: infratropical, thermotropical, mesotropical, supratropical and orotropical. As a statistical analysis shows (non-metric multidimensional scaling, MDS), most of them are concentrated in the mesotropical belt and a subhumid precipitation range. In addition a canonical correspondence analysis (CCA), using the altitude (m), the thermicity index (It) and annual precipitation (P) as environmental variables, indicates how active substances are also distributed with tendencies of them, showing phenolic substances and essential oils as mesotropical products, and complex alkaloids to the highest It values, while simple alkaloids to the lowest It values. Most of these molecular compounds are generated under the highest values of the subhumid and humid precipitation intervals. This bioclimatic method can led us to find new medicinal plants and active molecules.Este trabajo presenta una distribución de plantas medicinales y principios activos en el departamento de Cajamarca (Perú) bajo un criterio bioclimático. Los resultados muestran que 108 plantas medicinales están repartidas entre cinco pisos bioclimáticos: infratropical, termotropical, mesotropical, supratropical y orotropical. Como muestra el análisis estadístico realizado MDS (non-metric multidimensional scaling), la mayoría de plantas se concentra en el piso mesotropical y en el intervalo subhúmedo de precipitaciones. Además, un análisis canónico de correspondencias (CCA), donde intervienen la altitud (h), el índice de termicidad (It) y las precipitaciones anuales (P) como variables ambientales, indica cómo los principios activos también se distribuyen según tendencias de estas, mostrando a los compuestos fenólicos y aceites esenciales como productos mesotropicales, los alcaloides complejos hacia los valores más elevados de It, mientras que los alcaloides simples hacia los más bajos. Asimismo, la mayoría de estos compuestos tienen su óptimo en los valores más elevados del intervalo subhúmedo y el intervalo húmedo de precipitaciones. Este método bioclimático nos puede llevar a encontrar nuevas plantas medicinales y principios activos.