La composición de la comunidad, en conjunto con la distribución y abundancia de los macroinvertebrados bentónicos, fue estudiada en el sector de canales y fiordos interiores de la zona austral de Chile. El trabajo de terreno fue realizado durante el Crucero CIMAR 15 FIORDOS, a bordo del buque oceanográfico de la Armada de Chile “AGOR Vidal Gormaz”. Se utilizó una red de arrastre Agassiz modificada (AGT) para tomar datos semi-cuantitativos en 19 estaciones de muestreo, con profundidades que variaron entre 26-620 m. Un total de 61 taxones fueron identificados en 13 estaciones con lances exitosos. Los moluscos (16 taxones) y los equinodermos (15 taxones) fueron los grupos dominantes en términos de riqueza específica, en tanto que numéricamente los equinodermos fueron el grupo mayoritario (54%). El asteroideo Ctenodiscus procurator resultó ser la especie dominante (43%) en el conjunto de estaciones. Los resultados mostraron diferencias espaciales en la estructura y composición de macroinvertebrados, sugiriendo la existencia de dos ensambles asociados a la profundidad como factor principal. Se sugiere que la relativamente alta biodiversidad en estas áreas se mantiene por un alto remplazo de especies entre sitios, con sectores bien definidos y además diferenciados respecto de su composición biótica. Para futuros estudios, es altamente deseable una mayor densidad de estaciones de muestreo y la inclusión de métodos cuantitativos de toma de muestras complementarios a los semi-cuantitativos con una AGT.