The macrobenthic assemblages with mytilids of San Julián bay (Southern Patagonia; Argentina) were sampled in summer 2007 to know its structure; diversity and distribution; and to determine their relationship to different environmental factors. The study was conducted in 3 locations with different types of substrate and slope. Sampling at each site was performed in a transect to cover different levels of intertidal and shallow subtidal. A total of 46 species belonging mainly to molluscs (20); crustaceans (12) and polychaetes (10) were found. Three main macrofaunal assemblages were identified. Platynereis-Clunio- Darina assemblage was distributed in the upper intertidal of muddy and gentle slopes substrate; and had the lowest values of number of species; diversity and abundance of individuals. The Mytilus-Perumytilus assemblage was distributed in the middle and lower intertidal levels in rocky substrate or muddy substrate with abundant support elements and medium slope. This assemblage presented intermediate values of diversity and greater abundance of individuals. The Aulacomya-Exosphaeroma assemblage had the highest number of species and the greatest diversity; but low abundance of individuals; being related to rocky substrate or muddy substrate with support elements and low slopes in the upper subtidal. Species richness and diversity of these assemblages increases from the upper intertidal to subtidal; possibly because of a complex gradient of stress; mainly caused by desiccation and exposure to extreme temperatures.Las asociaciones de macrobentos con presencia de mitílidos de la bahía San Julián (Patagonia austral, Argentina) fueron muestreadas durante el verano de 2007 para conocer su estructura, diversidad y distribución, y para determinar su relación con diversos factores ambientales. El estudio fue realizado en 3 localidades con diferentes tipos de sustrato y distinta pendiente. El muestreo en cada localidad se realizó en una transecta abarcando diferentes niveles del intermareal y del submareal somero. Se hallaron un total de 46 especies pertenecientes principalmente a moluscos (20), crustáceos (12) y poliquetos (10). Se identificaron 3 asociaciones principales: la asociación Platynereis-Clunio-Darina se distribuyó en el nivel intermareal superior de sustrato fangoso y pendientes suaves y presentó los valores más bajos de número de especies, de diversidad específica y de abundancia de individuos; la asociación Mytilus-Perumytilus se distribuyó en los niveles intermareales medio e inferior en sustrato rocoso o en sustrato fangoso con abundantes elementos de soporte y pendiente media; presentó diversidad específica intermedia y la mayor abundancia de individuos; la asociación Aulacomya-Exosphaeroma presentó el mayor número de especies y la mayor diversidad, pero baja abundancia de individuos, encontrándose relacionado a sustratos rocosos o sustratos fangosos con elementos de soporte y baja pendiente del submareal superior. La riqueza específica y la diversidad de estas asociaciones aumentan desde el nivel superior del intermareal hacia el submareal, posiblemente por efecto de un gradiente complejo de estrés, principalmente ocasionado por la desecación y exposición a temperaturas extremas.