Xanthomonas arborícola pv. juglandis generates severe damage to different walnut cultivars. The bacterium is carried through water and can enter plants through natural plant openings. The objective of this work was to analyze the anatomical characteristics of leaves and fruits of two walnut cultivars, Chandler and Franquette, and relate these traits to disease severity. Leaf disease severity (SevH) was determined using the modified Spielman’s damage scale. Stomatal density (DE), length and width of stomata were measured using a microscope, and the size and density of lenticels (DL) in the fruits were measured using a stereoscopic microscope, with an ocular micrometer. Fruit disease severity (SevF) was evaluated using a scale that included 4 levels of severity. The results showed significant differences in SevH and DE between cultivars. Stomatal size presented statistical differences only in length, being greater in Chandler. A strong correlation (r = 0.98) was found between SevH and DE. In addition, significant differences were observed between Chandler and Franquette in terms of SevF and DL. However, no differences were observed in lenticel size. The results obtained allow inferring that DE and DL should be taken into account when analyzing the susceptibility or tolerance of cultivars against walnut blight. Xanthomonas arboricola pv. juglandis genera graves daños en diferentes cultivares de nogal. La bacteria se disemina por el agua y puede ingresar a través de entradas naturales de diferentes órganos de la planta. El objetivo de este trabajo fue analizar las características anatómicas de las hojas y los frutos de dos cultivares de nogal, Chandler y Franquette, y relacionarlas con la severidad de la enfermedad. La severidad de la enfermedad en la hoja (SevH) se determinó utilizando la escala de daño de Spielman, modificada. La densidad estomática (DE), el largo y el ancho de los estomas, se midieron utilizando un microscopio óptico, y el tamaño y la densidad de lenticelas (DL) en los frutos se midieron con un microscopio estereoscópico, ambos equipos con una escala ocular micrométrica. La severidad de la enfermedad en frutos (SevF) se evaluó mediante una escala que contempla 4 grados. Los resultados mostraron diferencias significativas en la SevH y en la DE entre los cultivares. El tamaño de los estomas presentó diferencias significativas solamente en la longitud, siendo mayor en cv. Chandler. Se determinó una fuerte correlación (r = 0,98) entre la SevH y la DE. Además, se observaron diferencias significativas entre cvs. Chandler y Franquette en términos de SevF y DL. No se observaron diferencias en el tamaño de las lenticelas. Los resultados permiten inferir que la DE yla DL son caracteres morfológicos a tener en cuenta cuando se analiza la susceptibilidad o tolerancia de cultivares de nogal frente a la peste negra del nogal.