The ability to regulate emotions is relevant to well-being, whereas the inability to adjust physiological systems in response to environmental demands is associated with the development and maintenance of psychopathology. Numerous studies demonstrate that Heart Rate Variability (HRV) is a psychophysiological marker of vagal regulation, which is reflected in psychological functioning indices. We recruited 201 volunteers: male and female undergraduate students (aged 18-29 years). Emotional regulation difficulties were measured with the Difficulties in Emotional Regulation Scale (DERS-E); psychological functioning, with the Outcome Questionnaire (OQ-30.2), and depressive symptomatology, with the Beck Depression Inventory (BDI-I). In addition, HRV was measured during a 5-min rest period with a built-in ambulatory electrocardiogram system as a valid psychophysiological measure of somatic processes underlying emotional processing. The aim was to demonstrate that: a) emotional regulation partially mediates the relationship between HRV and psychological functioning, and between HRV and depressive symptomatology; b) HRV is negatively associated with emotional regulation difficulties, impairments in psychological functioning, and depressive symptomatology; and c) emotional regulation difficulties are positively associated with impairments in psychological functioning, and depressive symptomatology. Results showed that the lower the HRV the higher the persons’ impairment in psychological functioning, when controlling for emotional regulation difficulties. However, HRV was not significantly related to participants' perception of emotional regulation difficulties nor with depressive symptomatology. Results are discussed and suggestions for future research are outlined.La capacidad de regular las emociones es relevante para el bienestar, mientras que la incapacidad de ajustar los sistemas fisiológicos en respuesta a las demandas del entorno se asocia con el desarrollo y el mantenimiento de la psicopatología. Numerosos estudios demuestran que la Variabilidad del Ritmo Cardíaco (VRC) es un marcador psicofisiológico de la regulación vagal, que se refleja en los índices de funcionamiento psicológico. Se reclutaron 201 estudiantes universitarios de ambos sexos (de 18 a 29 años) que participaron voluntariamente. Las dificultades de regulación emocional se midieron con la Escala de Dificultades de Regulación Emocional (DERS-E), mientras que el funcionamiento psicológico se midió con el Cuestionario de Resultados (OQ-30.2) y la sintomatología depresiva con el Inventario de Depresión de Beck (BDI-I). Además, se midió la VRC durante un período de descanso de 5 minutos con un sistema de electrocardiograma ambulatorio incorporado, como medida psicofisiológica válida de los procesos somáticos subyacentes al procesamiento emocional. El objetivo fue demostrar que: a) la regulación emocional media parcialmente la relación entre la VRC y el funcionamiento psicológico y entre la VRC y la sintomatología depresiva; b) la VRC se asocia negativamente con las dificultades de regulación emocional, los problemas en el funcionamiento psicológico y la sintomatología depresiva; y c) las dificultades de regulación emocional se asocian positivamente con los problemas en el funcionamiento psicológico y la sintomatología depresiva. Los resultados mostraron que a menor VRC mayor es el nivel de problemas en el funcionamiento psicológico de la persona, si se controlan las dificultades en la regulación emocional. Sin embargo, la VRC no se relacionó significativamente con la percepción de los participantes sobre las dificultades de regulación emocional ni con la sintomatología depresiva. Se discuten los resultados y se esbozan sugerencias para futuras investigaciones.