The flora, vegetation and the effect on the first from the March 2015 flood on two coastal wetlands (Las Salinas and Copiapo river mouth) located in the Atacama Region of Chile desert, were studied, working with traditional systematic and phytosociological methodology of Southern Europe. The flora consisted of 21 species from a phytosociological table of 88 vegetation samples, 11 species collected outside the samples and 11 that appeared after the 2015 flood, giving in total 44 species, with 34 native and 10 introduced. In the biological spectrum, phanerophytes, camephytes and hemicryptophytes dominated. Four plant formations were distinguished: submerged acuatic plants, swamp with large helophytes, marshes and forests. Ten plant associations were determined: 2 submerged Ruppietum maritimae and Charetum- asoc. nova prov., 3 swamps with large helophytes Typhaetum angustifoliae, Phragmitetum australis, Schoenoplectetum californiae, 5 from marshes Schoenoplectetum americanae, Chorizantho-Sarcocornietum neeii asoc. nova, Tessario-Distichletum spicatae asoc. nova, Tessario-Juncetum acutae asoc. nova and 1 forest Geoffreetum decorticans asoc. nova. New associations are described, adding phytosociological tables and a type vegetation sample is designated for each one. These results are discussed and the flora is compared with that of 5 other coastal wetlands in the Norte Grande of Chile, demonstrating the lack of basic studies of flora and vegetation in them.Se estudiaron la flora, la vegetación y el efecto sobre la primera del aluvión de marzo de 2015 en dos humedales costeros (Las Salina y Desembocadura del río Copiapó) ubicados en la región desértica de Atacama, Chile, trabajando con metodología sistemática tradicional y fitosociológica del Sur de Europa. La flora estuvo compuesta de 21 especies de una tabla fitosociológica de 88 censos, de 11 especies recolectadas fuera de los censos y de 12 que aparecieron después del aluvión de 2015, totalizando 44 especies, de las cuales 34 fueron nativas y 10 introducidas. En el espectro biológico dominaron fanerófitos, caméfitos y hemicriptófitos. Se distinguieron 4 formaciones vegetales: acuática sumergida, pantanos de grandes helófitos, marismas y bosques. Se determinaron 10 asociaciones vegetales: 2 sumergidas Ruppietum maritimae y Charetum- asoc. nova prov., 3 pantanosas de grandes helófitos Typhaetum angustifoliae, Phragmitetum australis, Schoenoplectetum californiae, 5 de marismas Schoenoplectetum americanae, Chorizantho-Sarcocornietum neeii asoc. nova, Tessario-Distichletum spicatae asoc. nova, Tessario-Juncetum acutae asoc. nova y una boscosa Geoffreetum decorticans asoc. nova. Se describen las asociaciones nuevas, se añaden tablas fitosociológicas y se designa un censo tipo para cada una. Se discuten estos resultados y la flora se compara con la de otros 5 humedales costeros del Norte Grande de Chile, demostrando la falta de estudios básicos de flora y vegetación en ellos.