This article presents a synthesis and discussion regarding congenital pathologies and developmental defects identified in the axial skeletons of individuals from different archaeological periods on the Antofagasta coast. Despite the small number of cases in the analyzed sample (n = 6), the research compares that figure with the cases reported for the coastal area of Arica and Tarapacá, revealing no statistically significant differences between the areas. Given the environmental and ethnohistorical background of the area, we propose that exposure to several natural contaminants and an endogamic kinship system are the most likely causes of these pathologies.    En el presente trabajo se presenta una síntesis y discusión sobre la presencia de patologías congénitas y defectos del desarrollo en individuos de diferentes periodos arqueológicos de la costa de la región de Antofagasta, en el norte de Chile, las que se concentran en el esqueleto axial. A pesar de ser un número bajo (n: 6), se realiza una comparación con aquellas reportadas para la zona costera de Arica y Tarapacá, obteniéndose que las diferencia entre ambas zonas no es estadísticamente significativa. Considerando antecedentes ambientales y etnohistóricos de la zona, se propone que una combinación a la exposición de diferentes contaminantes naturales, junto a un sistema de parentesco endogámico serían las causas más probables de la aparición de estas patologías.