Identification of cancer inhibitors from Hystrix brachyura bezoar extracts using LC-MS multivariate data analysis and in silico evaluation on Bcl-2, cyclin B/CDK1, VEGF and NM23-H1
Identificación de inhibidores de cáncer a partir de extractos de bezoar de Hystrix branchyura usando análisis multivariado LC-MS y evaluación in silico en Bcl-2, cyclin B/CDK1, VEGF, y NM23-H1
Author
Khan, Al’ aina Yuhainis Firus
Ahmed, Qamar Uddin
Khatib, Alfi
Ibrahim, Zalikha
Nipun, Tanzina Sharmin
Natto, Hatim Abdullah
Saiman, Mohd Zuwairi
Zakaria, Zainul Amiruddin
Wahab, Ridhwan Abdul
Full text
https://blacpma.ms-editions.cl/index.php/blacpma/article/view/39610.37360/blacpma.24.23.1.4
Abstract
Hystrix brachyura bezoar is calcified undigested material found in the gastrointestinal tract known for various medicinal benefits including as an anticancer agent. However, the H. brachyura population has been declining due to its demand and is under Malaysian law protection. Therefore, present study aimed to identify bezoar anticancer active compounds through metabolomics and in-silico approaches. Five replicates of bezoar powder were subjected to extraction using different solvent ratios of methanol-water (100, 75, 50, 25, 0% v/v). Cytotoxicity and metabolite profiling using liquid chromatography-mass spectrometry were conducted. Putative compounds identified were subjected to in-silico analysis with targeted anticancer proteins namely, Bcl-2, Cyclin B/CDK1 complex, VEGF and NM23-H1. The correlation of LC-MS and cytotoxicity profile pinpointed two compounds, mangiferin and propafenone. In-silico study showed both compounds exerted good binding scores to all proteins with hydrophobic interaction dominating the ligand-protein complex binding, suggesting the ligands act as hydrophobes in the interactions. El bezpar de Hystrix branchyura es material calcificado sin digerir encontrados en el tracto gastrointestinal, conocido por sus variados beneficios médicos, incluyendo propiedades anticancerosas. De todas formas, la población de H. Branchyura ha ido declinando debido a su demanda y está bajo la protección de la ley de Malasia. Por esto, este estudio busca identificar los componentes activos anticancerosos del bezoar mediante abordajes metabolómico e in silico. Cinco réplicas de polvo de bezoar fueron sometidos a extracción usando solventes con diferentes proporciones metanol-agua (100, 75, 50, 25,0% v/v). Se hicieron perfiles de citotoxicidad y de metabolitos usando cromatografía líquida-espectrometría de masa (LC-MS). Se identificaron compuestos putativos yse sometieron a análisis in silico, buscando las proteínas anticancerosas Bcl-2, complejo Cyclin B/CDK1, VEGF, y NM23-H1. La correlación LC-MS y el perfil de citotoxicidad identificaron dos compuestos: mangiferina y propafenona. El estudio in silico mostró que ambos compuestos tenían buenos índices de enlace con todas las proteínas con interacción hidrofóbica dominando el enlace complejo proteína-ligando, sugeriendo que los ligandos actúan como hidrófobos en las interacciones.