Aim: To identify the barriers and facilitators affecting the implementation of the HPV-Junaeb program from the perspectives of national, regional, and local institutional leaders and coordinators. Methods: Interviews with 16 program coordinators were conducted using the Consolidated Framework for Implementation Research model. This model groups implementation factors into five dimensions: characteristics of the innovation, external context of the implementing institution, internal context of the institution, characteristics of the individuals, and the implementation process. The interviews were followed by a deductive content analysis, classifying factors according to their contribution to implementation (facilitator [+] or barrier [–]) and their impact on it (2 = strong; 1 = weak; 0 = neutral). Results: Strong facilitators identified included the training of professionals responsible for program execution, active participation of students and the community, and the adaptation of the program to local needs and specificities. Strong barriers identified included cultural resistance to mental health care and the work of psychologists, low institutional resources and support, and weak coordination among various stakeholders. Conclusion: The study concludes that the program’s characteristics and its execution process are strong facilitators. In contrast, external contextual factors act as significant barriers to implementation. Continuous program evaluation is crucial to ensure its effectiveness and adaptability to diverse contexts.Objetivo: Identificar las barreras y facilitadores que afectan la implementación del programa HPV-Junaeb desde las perspectivas de los líderes y coordinadores institucionales a nivel nacional, regional y local. Métodos: Se realizaron entrevistas a 16 coordinadores del programa utilizando el modelo del Marco Consolidado para la Investigación en Implementación, que agrupa los factores de implementación en cinco dimensiones: características de la innovación, contexto externo de la institución implementadora, contexto interno de la institución, características de los individuos y proceso de implementación. La información se sometió a un análisis de contenido deductivo, clasificando los factores según su contribución a la implementación (facilitador [+] o barrera [–]) y su impacto en ella (2 = fuerte; 1 = débil; 0 = neutral). Resultados: Entre los facilitadores fuertes identificados se incluyeron la capacitación de los profesionales responsables de la ejecución del programa, la participación de los estudiantes y la comunidad, y la adaptación del programa a las necesidades y especificidades locales. Entre las barreras fuertes identificadas se incluyeron la resistencia cultural al cuidado de la salud mental y al trabajo de los psicólogos, la escasez de recursos y apoyo institucional, y la débil coordinación entre los diversos actores involucrados. Conclusión: Las características del programa y su proceso de ejecución son fuertes facilitadores. En contraste, los factores contextuales externos actúan como barreras significativas para la implementación. La evaluación continua del programa es crucial para garantizar su efectividad y adaptabilidad a diversos contextos.