Background: Factors associated with candidiasis and colonization in HIV-positive children and adolescents in developing countries are not well understood. Aim: To identify the factors associated with oral Candida colonization and candidiasis in institutionalized HIV-positive children and adolescents in Tijuana, México, as well as the response of the isolates to antifungals. Materials and Methods: Sample of the oral mucosa of 30 HIV positive children and adolescents were obtained to isolate and identify Candida species by culture and metabolic profile. Antifungal drugs susceptibility was determined according to CLSI. Indicators of immunological and virologic failure were classified in accordance to WHO criteria. Results: Six Candida species were identified from oral mucosa, 53% colonizers and 47% in candidiasis. Factors associated with candidiasis and oral colonization were viral load (p = 0,001), CD4+ counts (p = 0,002) and HAART regimen (p ≤ 0,014). The most prevalent species was C. glabrata (33%), but C. albicans (27%) was more resistant to fluconazole (p = 0,001). Itraconazol resistant species were identified in regimens that include an NNRTI (p = 0,041). Conclusion: HIV-positive children and adolescents living in an orphanage showed high prevalence of colonizing Candida spp. and resistance to antifungals, related to NNRTI.Introducción: Se desconocen los factores asociados a la candidiasis oral en población pediátrica con infección por VIH de los países en desarrollo. Objetivo: Identificar los factores asociados a la colonización por Candida, candidiasis oral y la susceptibilidad in vitro a antifúngicos, en niños y adolescentes con infección por VIH institucionalizados en la ciudad de Tijuana, México. Materiales y Métodos: Se examinó la cavidad oral de 30 niños y adolescentes con infección por VIH, se obtuvo una muestra de la mucosa oral para identificar las especies de Candida mediante cultivo y auxonograma. La susceptibilidad a los antifúngicos se determinó de acuerdo al CLSI. Los indicadores del estado inmunológico y falla virológica se clasificaron conforme a la OMS. Resultados: Se identificaron seis especies de Candida, 53% colonizantes y 47% causantes de candidiasis. Los factores asociados a candidiasis fueron alta carga viral (p = 0,001), menor recuento de LTCD4+ (p = 0,002) y esquema TARAA (p ≤ 0,014). La especie prevalente fue C. glabrata (33%); sin embargo, C. albicans (27%) fue más resistente a fluconazol (p = 0,001). Las especies resistentes a itraconazol se identificaron en esquemas que incluyen un INNTR (p = 0,041). Conclusiones: Los niños y adolescentes con infección por VIH institucionalizados mostraron una prevalencia elevada de Candida spp. colonizante y resistencia a los antifúngicos relacionada con los INNTR .