Xpert® MTB/RIF assay for tuberculosis diagnosis
Ensayo Xpert MTB/RIF en el diagnóstico de tuberculosis
Author
VALLEJO V, PATRICIO
RODRÍGUEZ D, JUAN CARLOS
SEARLE M, ANDREA
FARGA C, VICTORINO
Abstract
Xpert MTB/RF is an automatic methodology that uses the polymerase chain reaction to detect in less than two hours the presence of Mycobacterium tuberculosis and also informs about the sensibility to rifampicin. This technology has good sensibility and even better specificity in respiratory samples. In non-respiratory samples the sensibility is lower. We analyzed the results of samples sent to the Laboratory of Tuberculosis of the Instituto Nacional del Tórax-Chile (National Thorax Institute) during the last two years since we started to use this technology. We analyzed 529 samples, 384 (73%) of them were respiratory in origin and 145 (27%) were non-respiratory. Only 43 samples were positive for Mycobacterium tuberculosis, 33 from respiratory samples, and 10 from other sources. 17 smear negative samples were culture positive for Mycobacterium tuberculosis; 15 of them were detected by Xpert; 351 samples were culture negative, 17 of them were positive by Xpert, the majority in patients under treatment for tuberculosis or with old tuberculosis. Ten of 10 culture positive patients from non-respiratory samples were positive with Xpert. The interpretation of Rifampicin resistance, when its prevalence in a given population is low, like is the case in Chile, requires confirmation by using standard methods. Xpert MTB/RIF es un método automatizado basado en la reacción de la polimerasa en cadena que permite en menos de dos horas detectar la presencia de ADN de Mycobacterium tuberculosis y, además, informa la susceptibilidad a la Rifampicina. Esta técnica, que está disponible en el Instituto Nacional del Tórax (INT) desde hace dos años, tiene una buena sensibilidad y una mejor especificidad en muestras respiratorias. En muestras no respiratorias el rendimiento, aunque inferior, sigue siendo clínicamente útil. Se analizaron 529 muestras enviadas al Laboratorio de Tuberculosis del INT, comparándolas con el cultivo de Koch en medio sólido que es el "gold standard". El 73% (384) de las muestras fueron respiratorias y sólo 145 (27%) no respiratorias (líquido pleural, orina y líquido cefalorraquídeo). Del total de las muestras, 43 resultaron positivas para tuberculosis, de ellas, 33 eran de origen respiratorio y 10 no respiratorio. Todos los pacientes que tenían baciloscopias positivas fueron confirmados por el Xpert. De los 17 enfermos con baciloscopias negativas y cultivos positivos, 15 fueron detectados con el Xpert. De los 351 pacientes con cultivos negativos de las muestras respiratorias, 17 resultaron positivos por el Xpert, pero 8 de éstos estaban en tratamiento o habían tenido una tuberculosis anteriormente. En las muestras no respiratorias, de 10 pacientes con cultivos positivos el Xpert detectó los 10, demostrando también una excelente sensibilidad. En cuanto a la resistencia a Rifampicina, cuando la prevalencia de ésta en una población es baja, como ocurre en Chile, requiere confirmación por las técnicas estándar.