The automated BACTEC MGIT 960 system was compared with the method of proportion (MP) for testing susceptibility of Mycobacterium tuberculosis to antituberculous drugs. 275 strains of M. tuberculosis isolated in Chile from 270 patients between 2001 and 2003 were tested. Concordance of BACTEC MGIT 960 with MP depending on the antituberculous drug tested was the following: 97.0% for streptomycin, 98,9% for rifampicin, 97,4% for isoniazid and 98,1% for ethambutol. Total resistance to antituberculous drugs of the 275 strains of M. tuberculosis tested varied from 20.4 % assessed by MP to 25.1% evaluated by BACTEC MGIT 960. These differences were not significant (p: ns; t test). BACTEC MGIT 960 yielded 17 strains as resistant. These same 17 strains were detected as sensitives by MP. Therefore, BACTED MGIT overestimates the number of resistant strains. In our study BACTEC MGIT 960 showed a very good concordance with MP and besides it allowed to get the results in a much shorter period of time than MP. Additional analysis are needed to know the factors envolved in BACTED MGIT overestimation of resistant strainsSe comparó el método automatizado BACTEC MGIT 960 con el método de las proporciones (MP) para la determinación de la susceptibilidad a drogas anti tuberculosas de 275 cepas de Mycobacterium tuberculosis aisladas de 270 pacientes en Chile entre 2001 y 2003. La concordancia del BACTEC MGIT 960 con el MP según las drogas estudiadas fue de: 97,0% para estreptomicina, 98,9% para rifampicina, 97,4% para isoniazida y 98,1% para etambutol. Los porcentajes globales de resistencia a drogas anti-TBC de las 275 cepas de M. tuberculosis estudiadas, determinados por el BACTEC MGIT960 y el MP fueron de 25,1% y 20,4% respectivamente. Esta diferencia no fue estadísticamente significativa. El BACTEC MGIT 960 dió como resistentes 17 cepas que fueron sensibles por el MP, sobrestimándose por este método la información de cepas resistentes. El BACTEC MGIT 960 en nuestra experiencia presentó una muy buena concordancia con el MP permitiendo un notable acortamiento en el tiempo de obtención de los resultados. Sin embargo, la mayor determinación de cepas resistentes por parte de este método requiere de nuevos análisis que permitan conocer los factores que inciden en este fenómeno