O objetivo do estudo foi analisar o conhecimento e condutas de alunos de graduação em odontologia de duas instituições de ensino, uma pública outra privada, frente à ocorrência de acidente com exposição a material biológico e controle de infecção, como também discutir o papel das instituições de ensino nesse contexto. Trata-se de um estudo transversal, descritivo de abordagem quantitativa, no qual foi aplicado um questionário semiestruturado, auto-aplicável e padronizado a 224 alunos. Foram exploradas: I- medidas de proteção, II- ocorrência de acidentes e conhecimento das condutas pós-acidente III- conhecimento, percepção do risco e esclarecimentos formalmente preconizados. Os resultados demonstraram vulnerabilidade dos alunos quanto à exposição ao material biológico potencialmente contaminado e que ambas as instituições necessitam reavaliar suas ações referentes ao risco biológico e prevenção de acidentes. A instituição que mantem um comitê de biossegurança e possui protocolo, bem divulgado, em caso de acidentes com exposição a material biológico, apresentou melhores resultados quanto ao uso do equipamento de proteção individual, notificação do acidente e testagem da imunidade após vacina para hepatite B. O estudo concluiu que as instituições de ensino têm participação importante e devem estabelecer regras e estratégias de intervenção a fim de reduzir os riscos.