En este trabajo se establece la calidad de agua del curso superior y medio del río Traiguén ubicado en la IX Región de la Araucanía en Chile. La caracterización fisicoquímica y microbiológica se efectuó fijando seis estaciones de muestreo, desde un lugar cercano a la naciente del río hasta el límite comunal de la ciudad de Victoria con Traiguén. Los valores mas bajos en los parámetros evaluados, los presentan las aguas de las estaciones 1 y 2 ubicadas fuera del límite urbano, contrariamente a lo que ocurre con las estaciones 3, 4 y 5 que muestran los efectos de los afluentes: planta lácteos, curtiembre y aguas servidas respectivamente. Los resultados de la parte microbiológica señalan que las aguas de ninguna de las estaciones del río pueden emplearse como fuente de abastecimiento para consumo humano por estar sobre los límites fijados por la norma chilena (NCh 409, 1984). Se presentan limitaciones en sus comunidades así como para su uso en regadío, y recreación con contacto directo.