Se analiza la distribución vertical y abundancia de larvas de crustáceos decápodos planctónicos en canales orientales de la isla Chiloé. Se relaciona la distribución de larvas con la hora de captura y marea, que interferirían con las migraciones verticales u ontogénicas descritas para el meroplancton. De las especies identificadas, las larvas de Neotrypaea uncinata fueron las más abundantes. Su distribución vertical, fue inversa a la descrita para la migración circadiaria de zooplancton, sin que se encontraran diferencias significativas en la abundancia en los dos estratos de profundidad. Las abundancias de larvas de Cancridae y Pinnotheridae, fueron las únicas que tuvieron diferencias significativas en ambos estratos, aunque inversas al patrón de distribución vertical circadiaria. La amplitud de marea y dinámica oceanográfica descrita para los canales del área de estudio, serían determinantes en la distribución de las larvas en el sector, sobreponiéndose el transporte de ellas al comportamiento migratorio descrito para el zooplancton en general.