Los fitoesteroles son potenciales disruptores endocrinos. Se cuantificaron fitoesteroles en sedimentos de cuatro zonas costeras y dos ríos en el centro-sur de Chile. Se determinó la concentración de esteroles utilizando cromatografía de gas con espectrómetro de masa y las fuentes de materia orgánica sedimentaria se determinaron utilizando proporciones de esteroles y biomarcadores lipídicos. Las concentraciones de esteroles totales (0,03 a 10,4 μg g-1) se encuentran dentro del rango informado para otros ecosistemas marinos y la concentración de β-sitosterol (0,01 a 2,01 μg g-1) fue menor que la previamente informada para el sistema de surgencia de Perú. Algunas estaciones costeras adyacentes a los ríos presentaron β-sitosterol de origen terrestre. Además se encontró una alta concentración de este compuesto en sedimentos de estaciones más oceánicas, confirmando que este esterol también puede ser producido por fitoplancton. Al considerar la concentración y presencia-ausencia de esteroles en sedimentos, no fue posible encontrar diferencias significativas entre las cuatro áreas costeras. Sin embargo, se obtuvo una clara diferencia entre las áreas costeras y los ríos, así como entre ambos ríos. Considerando todas las estaciones y utilizando diferentes biomarcadores del origen de la materia orgánica, se encontraron algunas áreas con clara influencia terrestre, donde se asume que la fuente de origen de los fitoesteroles (especialmente β-sitosterol) podrían ser las plantas vasculares. El río BioBío y su desembocadura poseen una amplia diversidad de esteroles y lípidos, y altos niveles de colesterol y epicholestanol, los que estarían posiblemente relacionados a la presencia de efluentes domésticos provenientes de grandes ciudades. No se observaron claros patrones espaciales entre la ubicación de las industrias de celulosa y la concentración de β-sitosterol en sedimentos, excepto para una estación ubicada en el golfo de Arauco.