RESUMEN. Dada la capacidad de hibridación entre Mytilus edulis platensis y M. galloprovincialis, se planteó evaluar la variabilidad genética de la descendencia híbrida en relación a las especies puras a partir de 8 loci de microsatélites. Se observaron diferencias genéticas entre la descendencia híbrida en comparación a las especies puras, siendo la descendencia híbrida la que presenta los mayores valores de heterocigosidad observada promedio (Ho = 0,63 ± 0,28), con valores de endogamia que tienden mayoritariamente hacia valores de Fis negativos, evidenciando un exceso de heterocigotos en los híbridos en comparación a los individuos puros, quienes presentaron desvíos significativos hacia valores de Fis positivos. El análisis de componentes principales muestra tres grupos claramente diferenciados entre las muestras analizadas, identificando a la descendencia híbrida como un grupo intermedio entre las especies puras.