A partir de especímenes examinados, revisión de colecciones de referencia y literatura, se determina la presencia en los mares mexicanos de cuatro especies de cefalocordados (dos géneros y una familia). Además, se precisan las localidades de registro y una clave taxonómica para su identificación. En el Golfo de México y Caribe mexicano se registra la presencia de tres de las cuatro especies, de las cuales Branchiostoma caribaeum tiene la mayor área de distribución, desde la costa de Veracruz hasta la Península de Yucatán; B. longirostrum solo está registrada en la zona occidental del Golfo de México y Asymmetron lucayanum frente a la costa noreste de Yucatán. Branchiostoma californiense es la única registrada en la costa del Pacífico mexicano pero tiene amplia distribución.