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dc.creatorTorres,Pamela
dc.creatorEissler,Yoanna
dc.creatorTapia,David
dc.creatorEspinoza,Juan Carlos
dc.creatorKuznar,Juan
dc.date2016-09-01
dc.date.accessioned2019-05-03T13:28:02Z
dc.date.available2019-05-03T13:28:02Z
dc.identifierhttps://scielo.conicyt.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-560X2016000400023
dc.identifier.urihttp://revistaschilenas.uchile.cl/handle/2250/88254
dc.descriptionSe analizaron muestras de órganos (riñón y bazo) de las principales especies de salmónidos cultivados en Chile a través de la reacción en cadena de la polimerasa anidada (PCR anidado) para detectar la presencia del virus de la necrosis pancreática infecciosa (IPNV). La técnica resultó ser eficiente y sensible, permitiendo amplificar material genético del virus para su secuenciación directamente desde los tejidos, incluso desde muestras que no pudieron ser aisladas en cultivo celular. A través del análisis filogenético se detectaron los dos genogrupos descritos previamente en el país, i.e., europeo (Genogrupo 5) y americano (Genogrupo 1), siendo cuantitativamente predominantes los IPNV del Genogrupo 5 (78,8%). Dentro del Genogrupo 1, se observó claramente la formación de un sub-grupo de virus chilenos separados de las cepas de referencia (e.g., WB, VR-299), por lo que se propone su denominación como genotipo chileno. Adicionalmente, se observó una relación estadística-mente significativa hospedador-específica entre los genogrupos identificados: los virus del Genogrupo 5 provienen de Salmo salar mientras que los del Genogrupo 1 provienen de Oncorhynchus mykiss u O. kisutch (P < 0,001). La asociación de esta relación hospedador-específica con la virulencia puede proveer información importante para el manejo y control de IPNV en Chile.
dc.formattext/html
dc.languagees
dc.publisherPontificia Universidad Católica de Valparaíso. Facultad de Recursos Naturales. Escuela de Ciencias del Mar
dc.relation10.3856/vol44-issue4-fulltext-23
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.sourceLatin american journal of aquatic research v.44 n.4 2016
dc.subjectvirus
dc.subjectIPNV
dc.subjectPCR anidado
dc.subjectgenotipificación
dc.subjectfilogenia
dc.subjectrelación hospedador-específica
dc.subjectgen VP2
dc.subjectvirus
dc.subjectIPNV
dc.subjectnested PCR
dc.subjectgenotyping
dc.subjectphylogeny
dc.subjecthost-specific relation
dc.subjectVP2 gene
dc.titleGenotipificarión y relación hospedador-específica del virus de la necrosis pancreática infecciosa en Chile


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