Este artículo revisa los aspectos metodológicos más relevantes implicados en la Evaluación de las Tecnologías Sanitarias (ETESA). En primer lugar se aborda el proceso de definición del problema a investigar; luego se explican algunos aspectos puntuales de las revisiones sistemáticas de evidencia; y las comparaciones indirectas y mixtas de eficacia de intervenciones. Se abordan además, los métodos de evaluación económica en salud y de impacto presupuestario de las intervenciones. El artículo entrega además una visión empírica del énfasis metodológico que usan las agencias de ETESA en el mundo y reflexiona sobre las capacidades instaladas en nuestro país en los temas discutidos