Currently, school anxiety is regarded by the scientific world as an emotional disorder, influencing from childhood to adolescence. Previous studies treating this disorder in infant-youth population report a high prevalence worldwide of about 10 to 20 per cent of pupils. However, in Ecuador, this area of research remains neglected. For this reason, the objective of this study was to see if there are differences in school anxiety according to sex and course for 720 Ecuadorian adoelscents between 15 and 18 years of age, enrolled between 1st and 3rd grade. For this purpose, the Inventario de Ansiedad Escolar en Secundaria (IAES) was used. The results show significantly higher scores in the female sex for the total of the IAES, as well as all the scale factors. Also, the main differences were observed statistically significative betewwn first and third of high school. In conclusion, these results are similar to previous studies carried out in other countries, which advocates the importance of designing and implementing programmes for intervention and prevention of school anxiety in the field of education.En la actualidad, la ansiedad escolar es considerada por el ámbito científico como un trastorno emocional, que influye desde la infancia hasta la adolescencia. Los estudios previos que tratan este trastorno en población infanto-juvenil informan de una alta prevalencia a nivel mundial alrededor de entre el 10% y el 20% del alumnado. Sin embargo, en el país de Ecuador, esta área de investigación permanece desatendida. Por este motivo, el objetivo del presente estudio fue observar si existen diferencias en ansiedad escolar en función del sexo y curso para 720 adolescentes ecuatorianos entre 15 y 18 años de edad, matriculados entre 1º y 3º de bachillerato. Para ello, se utilizó el Inventario de Ansiedad Escolar en Secundaria (IAES). Los resultados arrojan puntuaciones significativamente más altas en el sexo femenino para el total del IAES, así como todos los factores de la escala. Asimismo, se observaron las principales diferencias estadísticamente significativas entre primero y tercero de bachillerato. En conclusión, estos resultados son similares a estudios previos realizados en otros países, lo que aboga por la importancia de diseñar y aplicar programas de intervención y prevención de la ansiedad escolar en el ámbito educativo.