En Chile, durante el proceso de transición a la democracia se producen dos fenómenos sociopolíticos importantes, estrechamente relacionados. Por un lado, el movimiento indígena demanda al estado políticas de reconocimiento a la diferencia. Por otro lado, una parte de la administración estatal (sectores definidos como “sociales”, en especial educación y salud) inicia un proceso de instalación de políticas y programas vinculadas a los pueblos indígenas en el quehacer institucional. Este trabajo tiene como propósito analizar críticamente la política del Ministerio de Salud en el campo de la salud y los pueblos indígenas con el fin de mapear y caracterizar sus distintos momentos desde la década de 1990 a la actualidad. Metodológicamente, el trabajose nutre de la experiencia profesional activa de su autora como antropóloga en el estado, en especial en la implementación y el diseño de la política de salud intercultural, así como del análisis de documentos oficiales producidos en este campo. Siguiendo la perspectiva teórica de la etnografía del estado, se identifican tres momentos en el despliegue de la política, marcados por énfasis distintos, que, sin embargo, responden a un mismo modelo acotado de interculturalidad que no ha conseguido permear el corazón de la política pública.