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Genetic analysis of the mutations in HIV-1 infected population in Ecuador

Análisis genético de las mutaciones presentes en las poblaciones virales en pacientes con infección por VIH-1 en Ecuador

dc.creatorGonzález-González, Manuel
dc.creatorCorrea-Sierra, Consuelo
dc.creatorHermida-Álava, Katherine
dc.creatorMachado-Díaz, Ana
dc.creatorGómez-Andrade, L. Fernando
dc.creatorCastillo-Segovia, Martha
dc.creatorPérez-Santos, C. Lissette
dc.creatorKourí-Cardelláciones, Vivian
dc.date2018-02-28
dc.date.accessioned2019-04-16T14:41:19Z
dc.date.available2019-04-16T14:41:19Z
dc.identifierhttp://revinf.cl/index.php/revinf/article/view/22
dc.identifier.urihttp://revistaschilenas.uchile.cl/handle/2250/40704
dc.descriptionBackground: The international recommendations of antiretroviral treatment include resistance tests to guide the treatment regimen in each patient, which is not available on a regular basis in Ecuador. Aim: To describe mutations that confer resistance to antiretrovirals in a population of Ecuadorian patients. Methods: Plasma samples from 101 HIV-1 patients with failure to antiretroviral therapy, divided into 15 children and 86 adults, were studied with the GS Junior (Roche) and the sequences were analyzed with the DeepChek program. Results: The most frequent mutations were M184V/I, K101E/P/H, K103N/S, D30N, M46L/I, I54L/M, V82T/F/A/S/L and L90M in adults and F77L, K103N/S, M46L/I, V82T/F/A/S/L and L90M in children. High resistance to non-nucleoside reverse transcriptase (RT) inhibitors in minority viral populations of adults and children (34.9% and 70%) was detected; in children both viral populations (majority and minority viral populations) (> 45%) were protease inhibitor resistant. Patients who had a greater number of therapeutic regimens had higher levels of resistance to antiretrovirals. Most of the samples were subtype B in the TR and protease region, and CRF25_cpx in integrase. Conclusions: Mutations and resistance to antiretrovirals are shown in a population of Ecuadorian patients with HIV-1. These results will make it possible to issue a warning to health authorities about the need for resistance studies.en-US
dc.descriptionIntroducción: Las recomendaciones internacionales de tratamiento anti-retroviral incluyen pruebas de resistencia para orientar el régimen de tratamiento en cada paciente, lo que no está disponible de forma estable en Ecuador. Objetivo: Describir las mutaciones que confieren resistencia a anti-retrovirales en una población de pacientes ecuatorianos. Metodología: A partir de muestras de plasma de 101 pacientes con VIH-1 con fallo a la terapia anti-retroviral, 15 niños y 86 adultos, se realizó pirosecuenciación con el GS Junior (Roche) y se analizaron las secuencias con el programa DeepChek. Resultados: Las mutaciones más frecuentes fueron M184V/I, K101E/P/H, K103N/S, D30N, M46L/I, I54L/M, V82T/F/A/S/L y L90M en adultos, y F77L, K103N/S, M46L/I, V82T/F/A/S/L y L90M en niños. Se encontró una elevada resistencia a los inhibidores de la transcriptasa reversa (TR) no análogos de nucleósidos en poblaciones minoritarias virales de adultos y niños (34,9 y 70%, respectivamente), en los niños, tanto las poblaciones virales mayoritarias como minoritarias, fueron resistente a inhibidores de proteasa (> 45%). Los pacientes que tuvieron un mayor número de esquemas terapéuticos presentaron mayores niveles de resistencia a los anti-retrovirales. La mayoría de las muestras fueron del subtipo B en la región de la TR y proteasa, y CRF25_cpx en integrasa. Conclusiones: Se muestran las mutaciones y la resistencia a antiretrovirales en una población de pacientes ecuatorianos con infección por VIH-1, que permitirán realizar un llamado de alerta a las autoridades de salud sobre la necesidad de realizar estudios de resistencia.es-ES
dc.formatapplication/pdf
dc.languagespa
dc.publisherSociedad Chilena de Infectologíaes-ES
dc.relationhttp://revinf.cl/index.php/revinf/article/view/22/21
dc.rightsCopyright (c) 2018 Revista Chilena de Infectologíaes-ES
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0es-ES
dc.sourceRevista Chilena de Infectología; Vol. 35, Núm. 1 (2018): Febreroes-ES
dc.source0717-6341
dc.source0716-1018
dc.subjectVIH/SIDAes-ES
dc.subjectEcuador; VIH; resistencia; anti-retroviral; mutaciones; subtiposes-ES
dc.subjectEcuador; HIV; resistance; antiretroviral; mutations; subtypesen-US
dc.titleGenetic analysis of the mutations in HIV-1 infected population in Ecuadoren-US
dc.titleAnálisis genético de las mutaciones presentes en las poblaciones virales en pacientes con infección por VIH-1 en Ecuadores-ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.typeen-US
dc.typees-ES


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