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Evaluation of a reverse hybridization assay for the identification of Mycobacterium in Chile

Evaluación de una técnica de hibridación reversa para identificación rápida de micobacterias en Chile

dc.creatorLeiva C, Tamara
dc.date2012-03-01
dc.date.accessioned2019-04-16T15:01:49Z
dc.date.available2019-04-16T15:01:49Z
dc.identifierhttps://revchilenfermrespir.cl/index.php/RChER/article/view/412
dc.identifier.urihttp://revistaschilenas.uchile.cl/handle/2250/41154
dc.descriptionObjective: Identification for Mycobacterium assay based in the new technology of reverse hybridization DNA probe assay was evaluated (Line Probe Assays-LiPAs). Methods: 74 strains belonging to 23 mycobacterial species or complex classified previously by classical biochemical methods, genetic probes and PRA (patterns of restriction analysis), with and without specific pattern expected to be identified at specie level were analysed.The utilized test, GenoType CM (Hain Lifescience, Nehren, Alemania), is able of identifying 14 of the most common mycobacterial species after a multiplex PCR technique targeting a 23S rRNA gene region followed by reverse hybridization technology. Results: Sensitivity of 94.0% (95% CI: 84.4-98.0%) and specificity of 88.0% (95% CI:46.7-99.3%) were obtained with the assay. Conclusion: GenoType CM is an appropriated tool for the identification of Mycobacteria, rapid, sensitive, operational in the current working conditions of the National Reference Laboratory of Mycobacteria in Chile and it might constitute a real breakthrough for shortening the time delay in the procedure, providing a better opportunity to use treatment only in cases where it is required.en-US
dc.descriptionObjetivos: Se evalúa una técnica para la identificación de micobacterias basada en la nueva tecnología de hibridación en tiras con sondas (Line Probe Assays-LiPAs). Métodos: Se analizaron 74 cepas, correspondientes a 23 especies y/o complejos, preclasificadas mediante pruebas bioquímicas tradicionales, sondas genéticas y PRA (análisis de patrones de restricción), identificables y no identi-ficables a nivel de especie por el kit utilizado. El kit evaluado, GenoType CM (Hain Lifescience, Nehren, Alemania), permite la identificación genética molecular de 14 de las especies micobacterianas más comunes, mediante una PCR múltiple e hibridación reversa del producto en tiras con sondas de regiones genéticas de ARNr de 23S. Resultados: Con la utilización de este ensayo para identificación de Micobacterias se obtuvo 94,0% (CI95% 84,4-98,0) de sensibilidad y 88,0% (CI95% 46,7-99,3) de especificidad totales. Conclusiones: Se concluye que GenoType CM constituye una herramienta adecuada para la identificación de micobacterias, rápida, sensible, operativa en las actuales condiciones de trabajo del Laboratorio de Referencia Nacional de Micobacterias en Chile y que podría constituir un avance para el acortamiento en los tiempos que demora el proceso, lo que implica una mejor oportunidad de aplicación de tratamiento sólo en los casos en que éste sea requerido.es-ES
dc.languagespa
dc.publisherEditorial Iku Limitadaes-ES
dc.relationhttps://revchilenfermrespir.cl/index.php/RChER/article/view/412/823
dc.relationhttps://revchilenfermrespir.cl/index.php/RChER/article/view/412/824
dc.sourceRevista Chilena de Enfermedades Respiratorias; Vol 28 No 1 (2012): Revista chilena de enfermedades respiratorias; 9-15en-US
dc.sourceRevista Chilena de Enfermedades Respiratorias; Vol. 28 Núm. 1 (2012): Revista chilena de enfermedades respiratorias; 9-15es-ES
dc.source0717-7348
dc.source0716-2065
dc.titleEvaluation of a reverse hybridization assay for the identification of Mycobacterium in Chileen-US
dc.titleEvaluación de una técnica de hibridación reversa para identificación rápida de micobacterias en Chilees-ES
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/article
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.typeArtículo revisado por pareses-ES


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