El presente artículo da cuenta de la reflexión pedagógica en torno a la enseñanza y desarrollo de la competencia argumentativa en estudiantes de grado noveno de la Institución Educativa Distrital Fanny Mikey de la Ciudad de Bogotá, D.C. La reflexión inició respondiendo el cuestionamiento ¿cómo el maestro enseñaba y potenciaba la argumentación en las clases de ciencias naturales?, y se continuó con la consolidación de los ajustes realizados en la práctica pedagógica a partir de la implementación de rutinas de pensamiento como estrategia para mejorar el nivel de argumentación en los escritos sobre ciencias biológicas de los estudiantes de noveno grado. El estudio se desarrolló bajo el diseño de investigación-acción basado en la reflexión de la enseñanza fundamentada en el uso de rutinas de pensamiento en las clases de ciencias, el propósito fue desarrollar la competencia argumentativa en los escritos de los estudiantes. Este proceso reflexivo comprendió tres fases: diagnóstica, de planeación y de  intervención; las fases fueron desarrolladas desde los ciclos de reflexión y sirvieron para identificar cambios significativos en la enseñanza de la argumentación, sus dificultades y los retos durante el desarrollo del estudio.